Après sa création en 1958,  l'équipe de l'AS.FAR  a joué en  deuxième division, l'objectif était alors de construire une équipe compétitive qui  puisse effectuer la montée en première  division et jouer avec l'élite du football marocain. Avant d'arriver à ce but, les militaires ont remporté la première Coupe du  Trône  de leur carrière ; c'était en 1959 contre la MCO alors que l'AS.FAR jouait en deuxième division.

En 1971, les militaires ont gagné leur deuxième coupe  devant le MAS, le match se terminait par un but partout, les  deux  équipes  sont  alors passé aux séries de tirs aux  buts qui ont donné la victoire aux militaires.

Le troisième titre de l'AS.FAR en Coupe du Trône était celui de 1984 face à la Renaissance Sportive de Kenitra. Les années suivantes, l'équipe militaire a gagné deux foix successivement la Coupe du Trône en 1985 et 1986, les deux foix contre DHJ.

A la fin des années quatre vingt dix, exactement en 1999, la génération de "Abdelkader Brazi" a gagné sa  première  coupe devant  le  SCCM  par 1-0,  le but a été  marqué  par "Armoumen".

Ces dernières années, l'AS.FAR, avec une nouvelle génération très  ambitieuse,  a remporté la Coupe du Trône deux foix successivement devant le WAC en 2003 et 2004.

Par ailleurs, en 2007 l'équipe militaire a pu gagner son 9ème titre de la Coupe du Trône face au Rachad de Barnoussi après la séance des tirs aux buts.

L'année 2008 les militaires ont fixé un nouveau rendez-vous avec cette fameuse coupe en gagnant pour la 10ème fois dans son histoire la Coupe du Trône ; c'était contre le MAS de Fès.

L'AS FAR, qui est déjà la plus titrée dans cette compétition, étoffe son palmarès d'un 11ème titre de coupe face au FUS en 2009. C'est la troisième coupe consécutive gagnée, les Militaires gardent définitivement ce onzième trophée.